More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3874 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3874  secretion protein HlyD  100 
 
 
337 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3942  cell wall surface anchor family protein  62.16 
 
 
343 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4085  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.15 
 
 
342 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4052  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.49 
 
 
343 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1691  RND family efflux transporter MFP subunit  57.28 
 
 
335 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  29.61 
 
 
373 aa  132  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  36.23 
 
 
366 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.12 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  35.01 
 
 
366 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.24 
 
 
377 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 
386 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.92 
 
 
353 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 
442 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  30.84 
 
 
478 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
478 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.58 
 
 
353 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 
472 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  29.04 
 
 
380 aa  99.4  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2181  AcrA/AcrE family protein  33.18 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000164809  normal  0.0114896 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  29.9 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.82 
 
 
379 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  33.01 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 
406 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 
347 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  30.18 
 
 
419 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 
358 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  31.62 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 
407 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.09 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  27.85 
 
 
337 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.19 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2869  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000418866  normal  0.697235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 
455 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 
404 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.42 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 
371 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 
372 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  27.57 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  29.02 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.28 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000223326  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  28.27 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  32.52 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 
372 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.82 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.38 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 
342 aa  84  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2794  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  32.94 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  26.69 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  27.18 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  27.73 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  23.05 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.85 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  31.54 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2396  secretion protein HlyD  29.32 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  31.61 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1413  secretion protein HlyD  29.71 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000766158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  27.2 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.15 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>