More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1691 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1691  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
335 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3942  cell wall surface anchor family protein  69.8 
 
 
343 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4052  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.13 
 
 
343 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4085  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.09 
 
 
342 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3874  secretion protein HlyD  57.06 
 
 
337 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.65 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.8 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  33 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
376 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 
390 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 
442 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  30.07 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 
353 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  28.04 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  24.82 
 
 
357 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 
410 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  30.8 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  28.63 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2396  secretion protein HlyD  28.32 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  29.19 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  27.6 
 
 
407 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  28.21 
 
 
478 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 
478 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0668  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.975013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2181  AcrA/AcrE family protein  31 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000164809  normal  0.0114896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3992  RND efflux system membrane fusion protein  30.38 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  34.18 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.45 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  29.47 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0664  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  27.64 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1279  HlyD family secretion protein  33.16 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0641  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.67 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.81 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  25.68 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  29.02 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  29.94 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.6 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  27.81 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5137  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.82 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  24.53 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1435  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 
359 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  27.12 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0697  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3571  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239658  normal  0.276589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 
1462 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25.96 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  30.97 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>