More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2719 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2719  type II secretion system protein E  100 
 
 		 316 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.616363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5246  type II secretion system protein E  31.73 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.337273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5445  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0323209  normal  0.0753929 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0066  type IV secretion system protein  25.55 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  33.33 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  30.34 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0020  type IV secretion system protein PilT  27.57 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  31.42 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  30.97 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  30.77 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  30.77 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  30.15 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  27.87 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  30.38 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  36 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  31.51 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  30.38 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  32.79 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  29.04 
 
 		 638 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5655  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0278  twitching motility protein  29.29 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5872  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  31.39 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  29.69 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  31.76 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  30.51 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  31 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  30.9 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  28.83 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  29.8 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  28.03 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  30.34 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.08 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  30.53 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  30.89 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  31.09 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  35.5 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  35.03 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  33.71 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  29.59 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1396  twitching motility protein  28.45 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  28.84 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.16 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  30.04 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  30.38 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  30.04 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  30.38 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  28.03 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  28.57 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  32.14 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  30.04 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  30.47 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  32.75 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  31.44 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  28.52 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  30.09 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  26.18 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  32.14 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  32.14 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  32.14 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  24.33 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  32.14 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  29.88 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  26.89 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  36.72 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  30.29 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  29.71 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4160  twitching motility protein  27.48 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  34.88 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  29.29 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4477  Tfp pilus assembly protein ATPase PilU  28.25 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  33.76 
 
 		 566 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  35.53 
 
 		 545 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  35 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  33.76 
 
 		 566 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 553 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  31.12 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  31.12 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  27.39 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  28.93 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  27.31 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  35.44 
 
 		 463 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  29.59 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  28.46 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 583 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  37.5 
 
 		 533 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  28.84 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1511  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.54 
 
 		 570 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  28.69 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  32.63 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  28.57 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  28.48 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  32.14 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>