More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0203 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 297 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  99.66 
 
 		 297 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  96.82 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  77.35 
 
 		 289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  56.68 
 
 		 292 aa  320  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  61.97 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  59.09 
 
 		 286 aa  298  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  55.67 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  53.98 
 
 		 284 aa  281  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  55.67 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  55.32 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  52.63 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  51.57 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  53.95 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  50.86 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  50.86 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  48.29 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  51.39 
 
 		 297 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  51.39 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  50.86 
 
 		 296 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  52.48 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  53.48 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  51.72 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  54.8 
 
 		 292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  47.04 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  52.3 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  48.93 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  52.67 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  54.07 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  48.08 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  49.3 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  51.97 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  55.17 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  48.94 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  48.21 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  51.23 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  46.98 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  51.6 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  45.8 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  42.36 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  42.57 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  43.51 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.38 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  40.97 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  45.65 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  44.53 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  40.93 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35.99 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  42.46 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  42.46 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  39.44 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.08 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.08 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.08 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  39.08 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  37.54 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  39.77 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  42.42 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  38.25 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  38.21 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  39.15 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  33.46 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  37.54 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  37.89 
 
 		 302 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  38.69 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  41.11 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  41.06 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  38.31 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  38.72 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  37.76 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  37.46 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  38.27 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  36.4 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  34.33 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  37.1 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.28 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  39.54 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  34.41 
 
 		 324 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  33.75 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  34.95 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  37.28 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  39.92 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  39.92 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  39.92 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.54 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  33.87 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>