78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2295 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  623  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  37.62 
 
 
300 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30.71 
 
 
328 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  35.36 
 
 
333 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  35.5 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  28.44 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  36.13 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  30.04 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  31.39 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  34.59 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  29.14 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  34.27 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  35.62 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  31.25 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  30.97 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  36.69 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  30.73 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  35.71 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  31.85 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  37.4 
 
 
450 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  27.41 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  26.74 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  31.62 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  28.99 
 
 
349 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  23.99 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3938  hypothetical protein  29.55 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  31.39 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  32.84 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  31.88 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  32.81 
 
 
374 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  31.53 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  28.96 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  26.41 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  34.35 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  35.24 
 
 
128 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  24.81 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  33.08 
 
 
154 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  27.21 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  34.92 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  33.08 
 
 
154 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  33.08 
 
 
125 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  33.08 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  28.63 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  28.63 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  25.39 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  35.96 
 
 
184 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.33 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32 
 
 
421 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  32.33 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  26.39 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  25 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  31.58 
 
 
230 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  24.63 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  25.4 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  26.95 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  23.27 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  25.29 
 
 
325 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  29.84 
 
 
374 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  28.93 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  33.58 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  29.93 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  31.53 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  31.01 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.13 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  24.54 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  23.51 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  30 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  27.5 
 
 
215 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  30.89 
 
 
454 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  36.67 
 
 
454 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  29.66 
 
 
453 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  27.21 
 
 
193 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  25.52 
 
 
455 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  22.76 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  31.53 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.25 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  30.83 
 
 
304 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1848  restriction endonuclease  30.93 
 
 
152 aa  42.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>