More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1848 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  100 
 
 		 841 aa  1637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  41.97 
 
 		 836 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  49.64 
 
 		 930 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  40.64 
 
 		 825 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 		 855 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  40.09 
 
 		 839 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  35.34 
 
 		 861 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.64 
 
 		 838 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  32.99 
 
 		 843 aa  323  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  34.21 
 
 		 845 aa  313  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  31.76 
 
 		 842 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  31.28 
 
 		 854 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  33.56 
 
 		 847 aa  298  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  32.45 
 
 		 834 aa  293  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.57 
 
 		 848 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  33.15 
 
 		 871 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 878 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 		 846 aa  283  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  35.68 
 
 		 828 aa  274  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 853 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.61 
 
 		 852 aa  264  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  30.82 
 
 		 849 aa  263  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 		 855 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30.68 
 
 		 880 aa  248  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  31.38 
 
 		 849 aa  248  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 873 aa  247  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 856 aa  247  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 		 859 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.3 
 
 		 859 aa  224  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 897 aa  223  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.72 
 
 		 821 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 		 853 aa  220  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.54 
 
 		 861 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  32.96 
 
 		 857 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.71 
 
 		 855 aa  206  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 		 857 aa  204  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 806 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.69 
 
 		 866 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 		 853 aa  191  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 873 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.17 
 
 		 835 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 846 aa  150  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  28.09 
 
 		 854 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.47 
 
 		 857 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.11 
 
 		 858 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.09 
 
 		 849 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.45 
 
 		 851 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.36 
 
 		 850 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.65 
 
 		 863 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.01 
 
 		 850 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 849 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.48 
 
 		 856 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 822 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.91 
 
 		 870 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 		 826 aa  114  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.91 
 
 		 855 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.42 
 
 		 842 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 822 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.01 
 
 		 866 aa  111  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  30.72 
 
 		 842 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 855 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  30.31 
 
 		 841 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  30.42 
 
 		 842 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 		 837 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  28.98 
 
 		 874 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  27.2 
 
 		 838 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 828 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.46 
 
 		 738 aa  105  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.73 
 
 		 852 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 		 826 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.5 
 
 		 829 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.24 
 
 		 858 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  18.96 
 
 		 829 aa  99  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  29.53 
 
 		 841 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.42 
 
 		 807 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.68 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.76 
 
 		 843 aa  84.3  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  26.6 
 
 		 858 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  24.65 
 
 		 841 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.67 
 
 		 684 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 857 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  28.83 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 		 833 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  23.1 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.71 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.09 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.91 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 835 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.87 
 
 		 416 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.11 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.09 
 
 		 413 aa  73.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  33.12 
 
 		 381 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  26.33 
 
 		 448 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  25.12 
 
 		 820 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.42 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.15 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 849 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.04 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.04 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>