More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3903 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
809 aa  1643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  37.59 
 
 
1009 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  35.93 
 
 
957 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
1060 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.05 
 
 
828 aa  300  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.12 
 
 
991 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
949 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.96 
 
 
944 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  34.82 
 
 
950 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 
885 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  34.54 
 
 
950 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 
854 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
868 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
1162 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.84 
 
 
1162 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.85 
 
 
782 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  31.9 
 
 
840 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
851 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  32.08 
 
 
891 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  32.97 
 
 
960 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.86 
 
 
3298 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
883 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  29.68 
 
 
853 aa  153  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
916 aa  153  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  33.25 
 
 
845 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 
904 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
905 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
905 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.68 
 
 
3535 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.68 
 
 
3419 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 
2741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 
2741 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.49 
 
 
3537 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.68 
 
 
3299 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.59 
 
 
447 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
822 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
796 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 
1101 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.27 
 
 
1266 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
412 aa  128  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.86 
 
 
1238 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
1313 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.84 
 
 
985 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.86 
 
 
1772 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.48 
 
 
1550 aa  124  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  25.81 
 
 
418 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.16 
 
 
2637 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.29 
 
 
2145 aa  122  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.57 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
343 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.16 
 
 
1650 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.73 
 
 
903 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.03 
 
 
919 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.64 
 
 
725 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
729 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.41 
 
 
1328 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.16 
 
 
717 aa  108  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  27.82 
 
 
689 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  31.72 
 
 
340 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
854 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  32.23 
 
 
1212 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.5 
 
 
532 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
923 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
454 aa  104  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.57 
 
 
825 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1261 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 
1186 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.83 
 
 
493 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.82 
 
 
740 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
1063 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
408 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
438 aa  98.6  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
1025 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  28.28 
 
 
725 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.68 
 
 
609 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.6 
 
 
1228 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.58 
 
 
1914 aa  95.1  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  26.03 
 
 
650 aa  94.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.1 
 
 
1404 aa  94  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
843 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.34 
 
 
2413 aa  92.8  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
760 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  24.53 
 
 
941 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  24.65 
 
 
364 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
1215 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.35 
 
 
698 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 
636 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 
968 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 
568 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
568 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
1279 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.5 
 
 
490 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.8 
 
 
732 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.4 
 
 
836 aa  88.2  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.57 
 
 
1288 aa  87.4  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.35 
 
 
1007 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.73 
 
 
694 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1040 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
1105 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>