More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4560 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  80.89 
 
 
979 aa  1394  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
975 aa  1963  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.69 
 
 
725 aa  400  1e-110  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
806 aa  364  5e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
806 aa  364  5e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  37.73 
 
 
821 aa  364  5e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
806 aa  364  5e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5918  glycosyl transferase family 51  34.73 
 
 
927 aa  360  1e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 
815 aa  357  6e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
830 aa  340  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
1245 aa  324  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
695 aa  317  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
950 aa  307  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.02 
 
 
814 aa  300  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  33.73 
 
 
836 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.72 
 
 
838 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
769 aa  292  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.28 
 
 
890 aa  286  1e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.43 
 
 
719 aa  286  2e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 
764 aa  285  4e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.74 
 
 
1129 aa  283  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
1065 aa  282  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  31.99 
 
 
727 aa  281  3e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
778 aa  276  2e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2691  glycosyl transferase family 51  35.94 
 
 
711 aa  275  2e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0728241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  32.17 
 
 
724 aa  275  4e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  34.16 
 
 
825 aa  273  9e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.02 
 
 
859 aa  270  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.6 
 
 
761 aa  265  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  33.58 
 
 
1117 aa  264  7e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
867 aa  257  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  30.12 
 
 
774 aa  257  8e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  32.51 
 
 
822 aa  256  1e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.64 
 
 
761 aa  255  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  30.62 
 
 
808 aa  253  9e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  28.59 
 
 
880 aa  251  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 
747 aa  248  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
819 aa  246  1e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  31.73 
 
 
764 aa  246  1e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  28.89 
 
 
784 aa  245  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  32.18 
 
 
961 aa  244  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 
765 aa  244  8e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.33 
 
 
712 aa  239  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  30.42 
 
 
817 aa  238  5e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.72 
 
 
643 aa  238  5e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.72 
 
 
643 aa  238  5e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.21 
 
 
648 aa  237  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  31.31 
 
 
1306 aa  236  1e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  31.04 
 
 
978 aa  236  2e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  29.84 
 
 
905 aa  235  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.76 
 
 
649 aa  234  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
871 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.19 
 
 
750 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.22 
 
 
643 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
758 aa  232  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
758 aa  230  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  30.14 
 
 
801 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 
766 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  31.21 
 
 
726 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  32.22 
 
 
722 aa  225  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 
661 aa  225  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
820 aa  224  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  30.77 
 
 
723 aa  223  2e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.25 
 
 
618 aa  222  2e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
710 aa  221  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.15 
 
 
763 aa  221  8e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  30.3 
 
 
773 aa  221  8e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 
626 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  29.71 
 
 
789 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  30.58 
 
 
803 aa  219  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  28.3 
 
 
811 aa  218  3e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  29.78 
 
 
814 aa  218  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
877 aa  217  1e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  29.88 
 
 
662 aa  216  2e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.69 
 
 
720 aa  216  2e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  27.76 
 
 
776 aa  216  2e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
710 aa  216  2e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  29.07 
 
 
892 aa  215  3e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 
668 aa  215  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  29.59 
 
 
681 aa  214  5e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  29.59 
 
 
751 aa  214  8e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 
714 aa  214  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 
704 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  29.86 
 
 
807 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  29.29 
 
 
712 aa  213  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  30.68 
 
 
752 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  28.92 
 
 
739 aa  211  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.62 
 
 
683 aa  210  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 
710 aa  209  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  28.1 
 
 
727 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  28.48 
 
 
735 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  28.31 
 
 
683 aa  208  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  28.31 
 
 
683 aa  208  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  29.95 
 
 
658 aa  207  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  28.38 
 
 
734 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  29.73 
 
 
625 aa  206  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  29.11 
 
 
770 aa  207  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  29.97 
 
 
680 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.6 
 
 
710 aa  206  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.21 
 
 
741 aa  206  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>