84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1626 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  948    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  72.09 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  58.5 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  55.46 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  57.78 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  58.16 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  57.82 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  58.41 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  57.2 
 
 		 457 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  55.42 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  53.32 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.91 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.04 
 
 		 464 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  55.83 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  53 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  49.8 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  48.25 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  51.66 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  51.45 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  50.72 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  48.32 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.25 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.72 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  52.95 
 
 		 464 aa  353  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  50.99 
 
 		 441 aa  349  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  54.89 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  51.76 
 
 		 455 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  48.66 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.77 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  50.2 
 
 		 468 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  49.5 
 
 		 462 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.19 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  48.56 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  49.17 
 
 		 464 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.39 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  46.78 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  47.19 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  47.54 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  313  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  45.92 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  44.12 
 
 		 439 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  53.71 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  44.79 
 
 		 466 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  54.03 
 
 		 415 aa  293  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  47.12 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  46.39 
 
 		 448 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.56 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  35.78 
 
 		 476 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  36.69 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  37.84 
 
 		 523 aa  177  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  39.22 
 
 		 477 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  37.68 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  37.39 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  38.33 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  30.84 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  29.91 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  38.59 
 
 		 673 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  32.99 
 
 		 840 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  45.95 
 
 		 168 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  29.76 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.72 
 
 		 2160 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.53 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.94 
 
 		 1296 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  30.48 
 
 		 523 aa  57  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  31.65 
 
 		 863 aa  57  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  35.17 
 
 		 1037 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.96 
 
 		 759 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.27 
 
 		 884 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.45 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.82 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  28.19 
 
 		 852 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  27.7 
 
 		 1359 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  36.25 
 
 		 717 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  34.55 
 
 		 294 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.4 
 
 		 601 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.91 
 
 		 541 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  25 
 
 		 1106 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  27.33 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  23.57 
 
 		 527 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  26.37 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  31.31 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1061 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.46 
 
 		 593 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 		 572 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>