181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4157 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 667 aa  1373    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  60.92 
 
 		 668 aa  875    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  71 
 
 		 661 aa  1005    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  63.71 
 
 		 663 aa  868    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  76.58 
 
 		 662 aa  1083    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  60.44 
 
 		 668 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  61.04 
 
 		 668 aa  883    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  41.25 
 
 		 710 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  41.82 
 
 		 688 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  41.2 
 
 		 688 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  41.2 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  41.2 
 
 		 688 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  40.39 
 
 		 723 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  40.09 
 
 		 719 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  38.12 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  38.17 
 
 		 698 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  38.17 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  39.74 
 
 		 726 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  39.58 
 
 		 676 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 749 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  40.19 
 
 		 753 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 745 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 749 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  39.43 
 
 		 676 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  38.34 
 
 		 687 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  38.34 
 
 		 709 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  37.73 
 
 		 684 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  36.38 
 
 		 687 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  38.04 
 
 		 713 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  39.04 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  36.31 
 
 		 724 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  38.72 
 
 		 681 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  38.88 
 
 		 681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  37.42 
 
 		 710 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  37.46 
 
 		 667 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  37.21 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  35.03 
 
 		 691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  30.63 
 
 		 695 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.19 
 
 		 665 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 672 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 697 aa  207  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 699 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 681 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  51.61 
 
 		 185 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 760 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 668 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 661 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.18 
 
 		 699 aa  127  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 685 aa  127  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 768 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 696 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 698 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 673 aa  110  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 702 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 702 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.77 
 
 		 625 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 684 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 775 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.81 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 750 aa  77.4  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 713 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.16 
 
 		 712 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3241  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  25.32 
 
 		 687 aa  70.5  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  26.07 
 
 		 248 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 721 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 688 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.84 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  23.12 
 
 		 739 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 735 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  32.09 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 705 aa  64.3  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  22.31 
 
 		 713 aa  63.9  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  21.23 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.27 
 
 		 628 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  20.74 
 
 		 741 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  23.92 
 
 		 701 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  23.46 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 729 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.61 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>