More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0909 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  64.51 
 
 		 541 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  63.25 
 
 		 547 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  100 
 
 		 523 aa  1058    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  64.51 
 
 		 541 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  54.86 
 
 		 520 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  54.01 
 
 		 525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  54.18 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  55.06 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  38.89 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  38.59 
 
 		 235 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  38.59 
 
 		 235 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  36.5 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  38.19 
 
 		 371 aa  127  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  35.32 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  36.65 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  35.53 
 
 		 554 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  34.47 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  39.1 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  39.1 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  38.71 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  38.41 
 
 		 223 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.34 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.84 
 
 		 342 aa  107  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  35.75 
 
 		 386 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.24 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  36.36 
 
 		 219 aa  103  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.41 
 
 		 519 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  37.09 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.03 
 
 		 396 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  37.59 
 
 		 224 aa  97.1  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  37.58 
 
 		 332 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  34.02 
 
 		 226 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 286 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  40.62 
 
 		 625 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  36.05 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  39.84 
 
 		 625 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  39.84 
 
 		 625 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.84 
 
 		 625 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.59 
 
 		 376 aa  90.9  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  32.39 
 
 		 348 aa  90.1  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  35.33 
 
 		 356 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  38.17 
 
 		 625 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  35.32 
 
 		 229 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  36.42 
 
 		 228 aa  87.8  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  34.59 
 
 		 268 aa  87.4  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  38.92 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  35 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  33.8 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 639 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  31.58 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  37.34 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  32.46 
 
 		 225 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  31.65 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  31.65 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30.35 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  51.16 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  28.42 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  30.9 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  39.07 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  34.81 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  36.69 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  32.31 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  36.42 
 
 		 522 aa  77  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  37.68 
 
 		 291 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.67 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  29.09 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3159  Rhomboid family protein  26.43 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000555456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  41.41 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  36.3 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36.42 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  33.89 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.14 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  32.58 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  30.56 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  38.75 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  31.97 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.65 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  32.05 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2679  Rhomboid family protein  38.55 
 
 		 150 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252618  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  34.29 
 
 		 503 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  36.42 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  31.62 
 
 		 275 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  37.14 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 360 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  35.51 
 
 		 141 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  30 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  28.52 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  32.72 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  32.28 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.84 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>