39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2679 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2679  Rhomboid family protein  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  40.2 
 
 		 541 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  43.42 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  38.55 
 
 		 523 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  42.19 
 
 		 547 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  39.47 
 
 		 541 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  45.33 
 
 		 554 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  48 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  35.16 
 
 		 486 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  46.67 
 
 		 489 aa  52  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  34.51 
 
 		 747 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  41.25 
 
 		 365 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 487 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  36.49 
 
 		 487 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  35.53 
 
 		 569 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  36.47 
 
 		 520 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.4 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  40.79 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  33.66 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  40.79 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  35.63 
 
 		 528 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  36.05 
 
 		 520 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  38.16 
 
 		 358 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  34.11 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  34.92 
 
 		 525 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  41.25 
 
 		 286 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 371 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  40.54 
 
 		 519 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  37.35 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  37.8 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  33.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  35.19 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  41.18 
 
 		 386 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.72 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.72 
 
 		 342 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  31.88 
 
 		 503 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  35.8 
 
 		 669 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>