171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1487 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  60.13 
 
 
2073 aa  2071    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  61.22 
 
 
2078 aa  2144    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  67.52 
 
 
2091 aa  1387    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  66.84 
 
 
2078 aa  1389    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  69.55 
 
 
2075 aa  1439    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  67.12 
 
 
2092 aa  1375    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  100 
 
 
1813 aa  3547    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  64.55 
 
 
1014 aa  1211    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  36.54 
 
 
3554 aa  413  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.32 
 
 
2906 aa  319  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  71.77 
 
 
209 aa  291  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  30.81 
 
 
3737 aa  247  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  64.09 
 
 
998 aa  222  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  29.62 
 
 
2851 aa  218  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  66.45 
 
 
1333 aa  209  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  28.94 
 
 
4238 aa  208  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  56.22 
 
 
600 aa  189  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  56.22 
 
 
691 aa  189  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  31.04 
 
 
5143 aa  183  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1482  YadA domain protein  62.41 
 
 
595 aa  182  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  62.99 
 
 
1230 aa  182  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  73.87 
 
 
1212 aa  181  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  63.95 
 
 
563 aa  177  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  50.92 
 
 
3920 aa  174  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.7 
 
 
2914 aa  171  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  63.27 
 
 
565 aa  171  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  29.01 
 
 
4526 aa  160  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  58.16 
 
 
572 aa  157  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  56.67 
 
 
1411 aa  149  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  51.37 
 
 
601 aa  133  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  25.84 
 
 
3078 aa  133  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  25.41 
 
 
2868 aa  107  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  25.75 
 
 
2095 aa  96.3  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  29.19 
 
 
4726 aa  87  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  26.87 
 
 
4384 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  32.89 
 
 
1613 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  32.07 
 
 
4191 aa  82.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  33.33 
 
 
2392 aa  82.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  24.6 
 
 
827 aa  82.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.17 
 
 
2832 aa  79.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  32.57 
 
 
1549 aa  77.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  27.34 
 
 
617 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  24.54 
 
 
735 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  41.48 
 
 
1405 aa  74.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  29.72 
 
 
3718 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  26.12 
 
 
962 aa  73.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  24.86 
 
 
1516 aa  73.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  33.54 
 
 
597 aa  73.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  33.54 
 
 
597 aa  73.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  27.32 
 
 
3126 aa  72.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  42.31 
 
 
597 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  22.79 
 
 
1117 aa  72.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  28.52 
 
 
1197 aa  72.4  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  31.76 
 
 
2141 aa  72  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  28.52 
 
 
1197 aa  72  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  28.52 
 
 
1197 aa  72  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.3 
 
 
1068 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  27.66 
 
 
1451 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  32.51 
 
 
1186 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.25 
 
 
877 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  32.88 
 
 
3635 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  37.1 
 
 
1259 aa  70.1  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  37.39 
 
 
551 aa  69.7  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.3 
 
 
1012 aa  69.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  43.52 
 
 
1390 aa  69.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.72 
 
 
1190 aa  68.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  32.28 
 
 
1616 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  32.28 
 
 
1616 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  32.28 
 
 
1616 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  35.59 
 
 
2504 aa  67.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  36.73 
 
 
1246 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.19 
 
 
386 aa  67.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  24.28 
 
 
1125 aa  67  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  37.3 
 
 
1447 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  37.3 
 
 
1447 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  37.3 
 
 
1446 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  37.3 
 
 
1472 aa  67  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  28.92 
 
 
2493 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  37.3 
 
 
1342 aa  66.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  28.79 
 
 
2866 aa  65.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  35.59 
 
 
1440 aa  65.9  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  31 
 
 
548 aa  65.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  24.06 
 
 
1654 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  33.91 
 
 
1326 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  34.29 
 
 
963 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  34.29 
 
 
1235 aa  63.9  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  30.62 
 
 
1204 aa  62.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  26.6 
 
 
1072 aa  62  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  30.93 
 
 
536 aa  62.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  29.24 
 
 
898 aa  62.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  24.31 
 
 
737 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  28.79 
 
 
3355 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0602  adhesin  30.59 
 
 
404 aa  61.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0175  hypothetical protein  70.73 
 
 
52 aa  60.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  33.33 
 
 
279 aa  60.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  40.7 
 
 
1713 aa  60.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  28.94 
 
 
2814 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  33.33 
 
 
1674 aa  59.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  31.2 
 
 
418 aa  59.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  23.66 
 
 
3192 aa  58.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>