181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2021 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 500 aa  1033    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  50.7 
 
 		 496 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  40.69 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  40.53 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.83 
 
 		 505 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 491 aa  299  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  25.17 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  21.1 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0697  transcriptional regulator, XRE family  22.61 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280462  normal  0.896724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3376  XRE family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.307758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  23.42 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01702  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1879  XRE family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.639599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4449  hypothetical protein  23.23 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  0.892861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  22.06 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  23.48 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4792  XRE family transcriptional regulator  20.46 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118224  normal  0.264382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11152  transcriptional regulator  21.4 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0302  DNA-binding transcriptional regulator  21.67 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  23.02 
 
 		 513 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2895  XRE family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0594  hypothetical protein  21.86 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150494  normal  0.432719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  22.64 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 256 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  24.71 
 
 		 505 aa  53.5  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3851  XRE family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3944  XRE family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4059  XRE family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 230 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4705  transcriptional regulator, putative  21.09 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.65 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  22.99 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  21.09 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  23.62 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  23.32 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  21.78 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 477 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 528 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0218  transciptional regulator  20.48 
 
 		 508 aa  50.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 510 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0807  XRE family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 118 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 115 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  22.89 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2998  XRE family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  37.1 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  34.78 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 99 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 107 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 79 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 255 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1608  XRE family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.118934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2004  XRE family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.447226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1221  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  0.453619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 106 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  21.84 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 104 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 509 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 112 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000234539  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4724  hypothetical protein  21.53 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 110 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 89 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  35.29 
 
 		 107 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  23.53 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 806 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 282 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 89 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1178  XRE family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 508 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 76 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  20.8 
 
 		 464 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 107 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2316  XRE family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  22.26 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 197 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>