289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  908    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47853  predicted protein  34.68 
 
 		 1314 aa  173  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16400  hypothetical protein  39 
 
 		 203 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1369  hypothetical protein  33.67 
 
 		 190 aa  88.6  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3642  hypothetical protein  34.16 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3393  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3322  hypothetical protein  33.99 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1098  hypothetical protein  32.91 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  34.16 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  33.55 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  34.81 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  39.68 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0986  hypothetical protein  30.65 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  31.85 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 145 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  32.28 
 
 		 158 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  35.03 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 143 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  32.91 
 
 		 156 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  32.28 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  31.68 
 
 		 179 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 92 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.94 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 320 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  50.91 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  45.28 
 
 		 149 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  45.28 
 
 		 149 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  38.89 
 
 		 489 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 197 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 277 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 149 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  45.28 
 
 		 149 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 146 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 142 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.21 
 
 		 196 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 132 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  31.65 
 
 		 159 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 135 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40 
 
 		 210 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  44.23 
 
 		 149 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  33.76 
 
 		 158 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  28.93 
 
 		 155 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 114 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  45.28 
 
 		 149 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 104 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  30.57 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  37.5 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 130 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 123 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 85 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 355 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 266 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>