78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2577 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  100 
 
 
156 aa  312  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  56.49 
 
 
154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  53.85 
 
 
162 aa  189  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  56.49 
 
 
154 aa  184  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  55.41 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  53.59 
 
 
159 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  53.59 
 
 
159 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  51.61 
 
 
158 aa  174  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  51.95 
 
 
153 aa  173  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  53.55 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  50.65 
 
 
159 aa  168  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  51.61 
 
 
155 aa  168  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  53.8 
 
 
157 aa  166  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  49.34 
 
 
155 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  49.36 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  50.32 
 
 
154 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  47.1 
 
 
157 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  50.32 
 
 
156 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  46.67 
 
 
155 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  43.4 
 
 
159 aa  147  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  43.31 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  47.77 
 
 
156 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  50.64 
 
 
158 aa  142  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  42.86 
 
 
166 aa  140  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  47.47 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  43.83 
 
 
169 aa  136  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  49.33 
 
 
162 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  42.68 
 
 
166 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  45.64 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  42.28 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  48.67 
 
 
162 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  49.31 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  42.86 
 
 
158 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  43.4 
 
 
165 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  43.4 
 
 
165 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  42.42 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  42.28 
 
 
187 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  44.97 
 
 
159 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  43.05 
 
 
164 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  41.06 
 
 
168 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  41.98 
 
 
165 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  43.24 
 
 
167 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  41.06 
 
 
168 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  39.74 
 
 
169 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  41.1 
 
 
177 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  36.36 
 
 
182 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  43.24 
 
 
161 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  36.02 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  40.54 
 
 
156 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  37.33 
 
 
179 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  39.86 
 
 
158 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  37.33 
 
 
157 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  35.22 
 
 
168 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  37.74 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  36.6 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  34.59 
 
 
166 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  36.6 
 
 
166 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  34.81 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  33.54 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  37.75 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  40.52 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  34.42 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  29.14 
 
 
210 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35.03 
 
 
436 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  32.71 
 
 
210 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  27.43 
 
 
207 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  35.44 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  32.43 
 
 
211 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  26.86 
 
 
211 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  32.52 
 
 
218 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  35.29 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2298  hypothetical protein  22.97 
 
 
266 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173529  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  38.14 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1345  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>