More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47853 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47853  predicted protein  100 
 
 		 1314 aa  2722    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46628  predicted protein  47.59 
 
 		 488 aa  262  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47689  sensor kinase protein 4  36.67 
 
 		 838 aa  248  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.68 
 
 		 436 aa  173  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  25.44 
 
 		 827 aa  118  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 		 1226 aa  118  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 		 1101 aa  115  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 1711 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.43 
 
 		 2303 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55037  sensor kinase protein 3  26.72 
 
 		 1017 aa  112  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 957 aa  111  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 741 aa  109  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.82 
 
 		 1271 aa  108  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.65 
 
 		 877 aa  104  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 969 aa  104  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  25.11 
 
 		 782 aa  104  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 1182 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.17 
 
 		 1222 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.24 
 
 		 952 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2918  Cache sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 779 aa  103  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  28.74 
 
 		 594 aa  103  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 680 aa  102  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  24.32 
 
 		 682 aa  102  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 1039 aa  102  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 		 1133 aa  102  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  26.93 
 
 		 733 aa  101  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 		 1064 aa  101  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  25.77 
 
 		 662 aa  102  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 593 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 1431 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 700 aa  100  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 1223 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 1096 aa  100  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 		 1302 aa  100  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  25.23 
 
 		 1215 aa  100  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  25.85 
 
 		 631 aa  99.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 837 aa  99.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 1070 aa  99.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 686 aa  99  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.78 
 
 		 2279 aa  99  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 530 aa  99  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  26.52 
 
 		 553 aa  99  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0366  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 936 aa  98.6  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.977062  decreased coverage  0.000832087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  27.88 
 
 		 784 aa  98.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 868 aa  98.6  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  25.48 
 
 		 900 aa  98.2  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.58 
 
 		 772 aa  98.2  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.15 
 
 		 907 aa  98.2  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 681 aa  98.2  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 869 aa  97.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1002 aa  97.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  24.94 
 
 		 2109 aa  97.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 		 1406 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 		 604 aa  97.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 2153 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  27.92 
 
 		 661 aa  96.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.6 
 
 		 657 aa  97.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 631 aa  97.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  24.14 
 
 		 787 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  29.14 
 
 		 693 aa  97.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  25.24 
 
 		 1191 aa  96.3  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 932 aa  96.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 1002 aa  96.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 657 aa  96.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.59 
 
 		 1068 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 903 aa  96.3  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  25.33 
 
 		 858 aa  96.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  25.6 
 
 		 779 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 773 aa  96.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 1055 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 1029 aa  95.9  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  23.86 
 
 		 982 aa  95.5  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1001 aa  95.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  26.13 
 
 		 945 aa  95.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  25.47 
 
 		 1763 aa  95.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 1385 aa  95.5  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 		 863 aa  95.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 		 810 aa  95.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  24.59 
 
 		 1417 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 1204 aa  95.5  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 1029 aa  95.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1002 aa  95.1  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.72 
 
 		 835 aa  95.1  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16400  hypothetical protein  31.79 
 
 		 203 aa  95.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 		 1632 aa  95.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 791 aa  95.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.28 
 
 		 718 aa  94.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 		 1350 aa  94.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 690 aa  94.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 		 1499 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 		 1313 aa  94.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 1383 aa  94.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  24.38 
 
 		 797 aa  94.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.91 
 
 		 1271 aa  94.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  26.1 
 
 		 1206 aa  94  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 781 aa  93.6  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.38 
 
 		 1152 aa  94  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3944  two-component sensor/regulator  23.16 
 
 		 891 aa  93.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0305517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 		 1390 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 708 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>