76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0074 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  100 
 
 		 151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  39.22 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  42.76 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  38.93 
 
 		 179 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  39.74 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  39.07 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  39.07 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  37.75 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  37.33 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  37.16 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  41.22 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  40.4 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  38.46 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  38.41 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  40.27 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  37.66 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  40.54 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  36.24 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  38.93 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  39.74 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  39.6 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  35.53 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  37.09 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  40.54 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  36.71 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  36.94 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  34 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  34.44 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  37.58 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  37.66 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  36.42 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  39.49 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  36.31 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  37.75 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  35.76 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  37.16 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  35.76 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  37.58 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  36 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  36.24 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  39.49 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  37.01 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  36.84 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  34 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  39.35 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  34.81 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  35.81 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  32.48 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0257  hypothetical protein  29.75 
 
 		 462 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.150674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  34.84 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.81 
 
 		 436 aa  60.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  35.76 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  33.78 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  35.57 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  30.87 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  37.09 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  30.2 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  35.48 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  28.38 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  29.53 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  27.7 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  31.74 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  27.7 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  28.86 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  32.34 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0798  hypothetical protein  33.04 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188731  normal  0.107341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0872  hypothetical protein  31.3 
 
 		 351 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0832  hypothetical protein  31.3 
 
 		 351 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2298  hypothetical protein  34.48 
 
 		 266 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173529  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  31.55 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0307  hypothetical protein  47.5 
 
 		 268 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  37.68 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>