77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0188 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  100 
 
 
157 aa  317  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  51.27 
 
 
162 aa  153  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  50.96 
 
 
158 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  53.16 
 
 
154 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  46.84 
 
 
155 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  49.69 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  48.73 
 
 
153 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  46.84 
 
 
156 aa  143  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  49.37 
 
 
155 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  47.77 
 
 
157 aa  141  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  48.1 
 
 
154 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  46.84 
 
 
158 aa  140  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  46.54 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  46.54 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  46.84 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  47.47 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  48.43 
 
 
156 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  45.86 
 
 
155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  47.83 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  46.15 
 
 
158 aa  136  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  47.8 
 
 
156 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  46.94 
 
 
151 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  44.94 
 
 
155 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  44.94 
 
 
166 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  48.1 
 
 
154 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  44.3 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  43.03 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  43.03 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  40.61 
 
 
169 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  44.16 
 
 
157 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  42.68 
 
 
158 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2493  adenylate cyclase  43.23 
 
 
170 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  43.05 
 
 
177 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  40.88 
 
 
168 aa  120  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  46 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  40.61 
 
 
165 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  43.21 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3276  adenylate cyclase  43.59 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  42.14 
 
 
166 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  42.67 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  44 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3082  adenylate cyclase  41.18 
 
 
168 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  44.37 
 
 
162 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  41.06 
 
 
187 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  40.26 
 
 
179 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3399  adenylate cyclase  41.18 
 
 
168 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5046  adenylate cyclase  45.7 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.875551 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  37.74 
 
 
168 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  41.06 
 
 
161 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  42.38 
 
 
158 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2780  adenylate cyclase  42 
 
 
157 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3052  adenylate cyclase  34.62 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.599913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  39.1 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  37.74 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  39.1 
 
 
166 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2877  adenylate cyclase  39.16 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000889515  normal  0.0335198 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  37.74 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  31.46 
 
 
218 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  30.68 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4074  adenylate cyclase  34.9 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  32 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0825  adenylate cyclase  39.1 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  31.98 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  34.59 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  29.65 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  30.23 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  37.09 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1698  adenylate cyclase  38.96 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409123  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  28.65 
 
 
211 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  30.34 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  33.54 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  33.55 
 
 
436 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  33.33 
 
 
467 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0070  hypothetical protein  45.07 
 
 
80 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0257  hypothetical protein  27.78 
 
 
462 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.150674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>