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for query gene Sare_2343 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
524 aa  1012    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.92 
 
 
524 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  43.6 
 
 
537 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  38.84 
 
 
523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.63 
 
 
488 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 
522 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 
480 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.14 
 
 
502 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 
478 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
510 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 
478 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 
478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 
484 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 
508 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
489 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.25 
 
 
467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 
502 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.53 
 
 
488 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 
478 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 
478 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.14 
 
 
469 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.01 
 
 
475 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
528 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 
478 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.87 
 
 
522 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.54 
 
 
522 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
504 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
474 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
485 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  203  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  203  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.78 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 
458 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 
496 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
458 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 
489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.28 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 
529 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  34.17 
 
 
523 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.18 
 
 
466 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
457 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.49 
 
 
476 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
494 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 
531 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 
534 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 
539 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 
492 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 
500 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 
763 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  34.42 
 
 
482 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 
474 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 
452 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 
516 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.46 
 
 
519 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
490 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.72 
 
 
500 aa  186  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 
472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  28.63 
 
 
534 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
520 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.42 
 
 
478 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  34.09 
 
 
479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
506 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
534 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
540 aa  183  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  33.84 
 
 
483 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.89 
 
 
530 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 
483 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
501 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  33.84 
 
 
488 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.34 
 
 
468 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
527 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  33.84 
 
 
488 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.34 
 
 
468 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  31.86 
 
 
450 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.63 
 
 
505 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 
475 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
506 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
506 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
480 aa  179  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  34.19 
 
 
477 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
458 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
518 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 
511 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 
469 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 
512 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
475 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 
477 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  31.8 
 
 
509 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  33.8 
 
 
480 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
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