141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2946 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  100 
 
 		 242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  56.25 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  38.14 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  41.03 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35.11 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  39.78 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.59 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  36.67 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.23 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  37.36 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  37.36 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.23 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  28.28 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.7 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  38.16 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  35.06 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  38.75 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  38.71 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.56 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  38.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  38.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  38.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  38.27 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  38.27 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  38.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  38.27 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  38.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  43.55 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  38.27 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.97 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  34.18 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.05 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  30.86 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  39.19 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.26 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  31.07 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  29.67 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  38.57 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.95 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  41.07 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  45.61 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  41.07 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  27.92 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  29.49 
 
 		 277 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.17 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  41.07 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  41.07 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  30.77 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  41.07 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  32.91 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  29.49 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  29.07 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  41.07 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  35.71 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  31.17 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  37.97 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  37.5 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  31.17 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  35 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.33 
 
 		 117 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  32.47 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  31.17 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.94 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  31.17 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  35.37 
 
 		 565 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3042  hypothetical protein  30.67 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.145251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.87 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  31.17 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  26.25 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.33 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  33.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  36.23 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  31.4 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  32.58 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  34.57 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  27.71 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  31.4 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  38.1 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  30.77 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  34.09 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  31.4 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  36.47 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  35.53 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.57 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  36.21 
 
 		 115 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.49 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  40 
 
 		 108 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  40 
 
 		 108 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  29.87 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  34.18 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  27.91 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  30.77 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  27.91 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  37.68 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  34.33 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>