More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1769 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 512 aa  1010    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  46.32 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  42.5 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  41.17 
 
 		 524 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.69 
 
 		 533 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 		 534 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  40.12 
 
 		 532 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  42.08 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  41.92 
 
 		 533 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  40.21 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  40.17 
 
 		 526 aa  346  5e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 		 530 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.77 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.93 
 
 		 533 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.79 
 
 		 533 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 535 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 		 594 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  39.08 
 
 		 521 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 		 594 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  39.63 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.02 
 
 		 534 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 632 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.92 
 
 		 525 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.75 
 
 		 533 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  36.09 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 		 535 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 632 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 		 632 aa  312  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.17 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 533 aa  310  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.35 
 
 		 856 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 533 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  37.53 
 
 		 533 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.85 
 
 		 533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  37.58 
 
 		 625 aa  306  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  38.04 
 
 		 535 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.04 
 
 		 856 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.4 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  36.48 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  37.11 
 
 		 522 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 		 554 aa  302  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  37.7 
 
 		 534 aa  302  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  38.55 
 
 		 626 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  36.79 
 
 		 640 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.49 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  37.57 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.45 
 
 		 534 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 		 521 aa  299  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 		 505 aa  298  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 621 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  36.81 
 
 		 626 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.65 
 
 		 853 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  34.8 
 
 		 532 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.76 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  43.26 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.17 
 
 		 533 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 629 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  37.32 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.24 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 		 556 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  37.05 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  37.05 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 526 aa  294  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.51 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 		 681 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 526 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  35.45 
 
 		 629 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  36.81 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1108  preprotein translocase subunit SecD  35.07 
 
 		 625 aa  290  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0562212  normal  0.23819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 627 aa  289  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  35.57 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 615 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 615 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1277  preprotein translocase subunit SecD  34.87 
 
 		 625 aa  287  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000238254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 615 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 615 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  36.44 
 
 		 501 aa  286  5e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  41.71 
 
 		 399 aa  286  5.999999999999999e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.32 
 
 		 616 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 		 535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>