More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0080 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  69.81 
 
 		 620 aa  882    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.6 
 
 		 610 aa  781    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  62.77 
 
 		 610 aa  783    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.98 
 
 		 607 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.67 
 
 		 614 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  54.58 
 
 		 605 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.91 
 
 		 616 aa  656    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  52.5 
 
 		 604 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  56.05 
 
 		 617 aa  690    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  54.16 
 
 		 624 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.95 
 
 		 632 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  54.5 
 
 		 616 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 		 597 aa  1231    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  54.34 
 
 		 616 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.7 
 
 		 609 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  73.92 
 
 		 597 aa  935    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  60.59 
 
 		 609 aa  777    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  54.52 
 
 		 614 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  93.97 
 
 		 597 aa  1142    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  52.57 
 
 		 600 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.43 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.66 
 
 		 621 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.41 
 
 		 612 aa  607  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  49.6 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.13 
 
 		 622 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.08 
 
 		 621 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  47.52 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.69 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.69 
 
 		 623 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.55 
 
 		 628 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  46.02 
 
 		 606 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  43.5 
 
 		 592 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.2 
 
 		 626 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.83 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  43.33 
 
 		 589 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.72 
 
 		 577 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.19 
 
 		 630 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.57 
 
 		 608 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.8 
 
 		 584 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.61 
 
 		 600 aa  458  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  42.57 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.33 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.21 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.67 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  37.69 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  32.94 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.87 
 
 		 567 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  32.43 
 
 		 551 aa  276  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  33.22 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.36 
 
 		 550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.76 
 
 		 542 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 		 552 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.12 
 
 		 541 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  33.46 
 
 		 559 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.08 
 
 		 541 aa  266  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.59 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.59 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.59 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30.47 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.59 
 
 		 541 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.94 
 
 		 537 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  29.95 
 
 		 541 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 		 550 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  29.61 
 
 		 541 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  32.19 
 
 		 530 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.77 
 
 		 553 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  32.35 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.05 
 
 		 555 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.08 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 555 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.39 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.32 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.25 
 
 		 542 aa  257  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.07 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  29.95 
 
 		 545 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 552 aa  256  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.59 
 
 		 554 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.62 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.79 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.2 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.35 
 
 		 544 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  31.26 
 
 		 531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.74 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  28.83 
 
 		 542 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  31.09 
 
 		 570 aa  253  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.94 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  32.2 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  30.86 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  30.86 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.8 
 
 		 547 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>