More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0313 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1088    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  55.1 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  54.9 
 
 		 533 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0279  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0306  hypothetical protein  25.54 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.22 
 
 		 266 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  31.36 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  43.48 
 
 		 694 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  49.5 
 
 		 222 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.64 
 
 		 427 aa  100  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  50.5 
 
 		 219 aa  99  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.4 
 
 		 319 aa  99  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.07 
 
 		 375 aa  99.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  38.26 
 
 		 239 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 242 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.09 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 1026 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 230 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  48.51 
 
 		 218 aa  97.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 218 aa  97.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 294 aa  97.8  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 218 aa  97.1  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 225 aa  97.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.48 
 
 		 429 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.31 
 
 		 729 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 219 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.44 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 440 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.69 
 
 		 228 aa  94.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 537 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 212 aa  94  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 214 aa  94  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 230 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 230 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 230 aa  94  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 216 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 		 216 aa  93.6  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  29.11 
 
 		 277 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 459 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 228 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.52 
 
 		 584 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  42.61 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 222 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 230 aa  92.4  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 623 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 388 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.44 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.06 
 
 		 352 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.25 
 
 		 311 aa  91.3  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 544 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  45.35 
 
 		 321 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.72 
 
 		 707 aa  90.5  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 187 aa  90.5  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.19 
 
 		 542 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  40 
 
 		 670 aa  90.5  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 306 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.26 
 
 		 510 aa  90.1  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 210 aa  90.1  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 440 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.35 
 
 		 337 aa  89.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  41.75 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.9 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.58 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 217 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 264 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  46.94 
 
 		 342 aa  89  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 227 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  40.78 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 240 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3761  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.53 
 
 		 607 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 263 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 224 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.83 
 
 		 233 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  26.81 
 
 		 268 aa  88.6  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.9 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  36.57 
 
 		 673 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.75 
 
 		 464 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 464 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  46.39 
 
 		 217 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  39.5 
 
 		 237 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 217 aa  88.2  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 445 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 188 aa  88.2  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 239 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 768 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 224 aa  87.8  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>