More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0614 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  100 
 
 		 449 aa  914    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  63.72 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  60.71 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  57.76 
 
 		 440 aa  529  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  53.95 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  49.89 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  51.4 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  42.41 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.92 
 
 		 432 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.91 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  35.35 
 
 		 429 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  37.28 
 
 		 457 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.87 
 
 		 430 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.5 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.38 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.13 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.89 
 
 		 407 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  37.4 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.05 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  30.53 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  30.28 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  30.28 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  30.46 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.59 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.62 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  30.41 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.25 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  28.99 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  29.8 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  30 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.91 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  29.18 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.95 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.81 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.34 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.34 
 
 		 422 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.09 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.49 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.9 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  29.57 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  29.28 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  29.28 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.25 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.81 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  29.48 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.59 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.97 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  28.28 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  29.77 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.8 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  26.05 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  29.19 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.98 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.18 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  27.9 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  27.72 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  26.61 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  28.9 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28.07 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  27.03 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.23 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 432 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.44 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  28.5 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  24.94 
 
 		 427 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  27.49 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  26.33 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  27.49 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  28.27 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.94 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  28.41 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  28.66 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.69 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  27.42 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  27.52 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  28.41 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 439 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  28.99 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 430 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  27.95 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>