More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1636 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  55.28 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  53.27 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  52.26 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  52.76 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  54.04 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  52.85 
 
 		 208 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  55 
 
 		 181 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  49 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  51.32 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  48.63 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  51.65 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  51.65 
 
 		 194 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  50 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  34.36 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  48.65 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  33.33 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  26.57 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  41.3 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.07 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  26.94 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  36.26 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.56 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  26.71 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  33.7 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  39.19 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  28.87 
 
 		 258 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  39.56 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  35.87 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  41.56 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  41.56 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  41.56 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  43.66 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  27.98 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  36.84 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  35.63 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  34.4 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>