262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1890 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  100 
 
 		 348 aa  698    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  85.64 
 
 		 376 aa  616  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  64.76 
 
 		 248 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  36.1 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  36.84 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.5 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.84 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  33.64 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.31 
 
 		 554 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  32.7 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  32.87 
 
 		 225 aa  94.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  36.9 
 
 		 283 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  31.73 
 
 		 541 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 219 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.88 
 
 		 275 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  34.34 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  35 
 
 		 235 aa  90.1  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  35 
 
 		 235 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  33.69 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  34.38 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  31.98 
 
 		 523 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 279 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  31.46 
 
 		 528 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 286 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  32.5 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  37.09 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.29 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.6 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  35 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  38.85 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  29.77 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  40.13 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  32.2 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  34.39 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  30.95 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  32.2 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 		 625 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  32.6 
 
 		 625 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  33.68 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.6 
 
 		 625 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  31.93 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.15 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  39.24 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  32.82 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.52 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  32.97 
 
 		 625 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  30.85 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  28.86 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32.46 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  35.81 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  35.53 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  34.38 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  29.32 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  32.89 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  28.86 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  38.3 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  29.57 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  35.66 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  28.65 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  32.7 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  32.47 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  29.19 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  31.5 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  30.72 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  28.02 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  34.72 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  35.42 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  32.18 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.87 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.53 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  30.86 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  31.18 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 487 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 487 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  29.76 
 
 		 579 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 639 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  32.93 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  27.18 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  30.32 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  30.61 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  33.13 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  27.51 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  33.1 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  26.47 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  27.8 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  25.98 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  30.2 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  30.89 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>