166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19333 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19333  predicted protein  100 
 
 		 411 aa  850    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14166  predicted protein  33.58 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.55588  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  31.77 
 
 		 503 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  38.5 
 
 		 684 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56141  protein involved in cell-cycle regulation of histone transcription  25.92 
 
 		 959 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0125544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02950  transcription corepressor, putative  26.5 
 
 		 881 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414493  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06970  chromatin assembly complex protein, putative  30.35 
 
 		 812 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0273376  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24854  predicted protein  24.13 
 
 		 878 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0065395 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  22.33 
 
 		 1004 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33295  predicted protein  26.32 
 
 		 1186 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1789 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.18 
 
 		 919 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1196 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.58 
 
 		 676 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1552 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 		 1711 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 		 1247 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1176 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 		 1163 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 1161 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.3 
 
 		 737 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1714 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.15 
 
 		 1652 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1599 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 		 1686 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.59 
 
 		 1760 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.75 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.75 
 
 		 1454 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.4 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  31.71 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83887  Histone transcription regulator HIRA, WD repeat superfamily  22.14 
 
 		 993 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.520766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 		 947 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.35 
 
 		 1547 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.08 
 
 		 1217 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 		 1363 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1304 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.26 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.65 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.33 
 
 		 630 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27 
 
 		 696 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.63 
 
 		 1016 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.1 
 
 		 657 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.92 
 
 		 675 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 		 1016 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1229 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.13 
 
 		 1209 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 		 1557 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1661 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1190 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.41 
 
 		 1481 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 		 1373 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.33 
 
 		 740 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.89 
 
 		 1609 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 335 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1858 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.47 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.77 
 
 		 1330 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 1221 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1477 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 		 1004 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.26 
 
 		 1279 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.14 
 
 		 1623 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 		 1656 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.73 
 
 		 1262 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.35 
 
 		 1357 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  24.26 
 
 		 1279 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1211 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.42 
 
 		 924 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  27.7 
 
 		 551 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 687 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.23 
 
 		 930 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  28.47 
 
 		 516 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1491 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 		 1311 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 		 1411 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.32 
 
 		 833 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 		 1344 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.09 
 
 		 578 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.16 
 
 		 522 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1240 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.88 
 
 		 1267 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.85 
 
 		 596 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30.2 
 
 		 790 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.57 
 
 		 1364 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1553 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1510 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1399 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 		 1766 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.67 
 
 		 1242 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.76 
 
 		 1523 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.76 
 
 		 1039 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.07 
 
 		 1599 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.62 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>