More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1877 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1877  permease  100 
 
 		 808 aa  1597    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  47.84 
 
 		 797 aa  702    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  39.22 
 
 		 803 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  36.28 
 
 		 809 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.61 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  34.65 
 
 		 814 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 822 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  33.09 
 
 		 821 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 805 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  34.79 
 
 		 805 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.51 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  33.58 
 
 		 869 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.76 
 
 		 882 aa  365  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.29 
 
 		 805 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.69 
 
 		 802 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 		 871 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  35.68 
 
 		 808 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  33.01 
 
 		 865 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.38 
 
 		 823 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.57 
 
 		 816 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.37 
 
 		 809 aa  350  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.36 
 
 		 807 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 808 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.43 
 
 		 813 aa  344  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  33.65 
 
 		 831 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.89 
 
 		 805 aa  337  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.66 
 
 		 845 aa  337  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.21 
 
 		 883 aa  336  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.92 
 
 		 915 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.65 
 
 		 862 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.18 
 
 		 893 aa  324  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  34.1 
 
 		 810 aa  324  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.45 
 
 		 808 aa  321  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  35.02 
 
 		 800 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.19 
 
 		 808 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  31.68 
 
 		 809 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 		 807 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.52 
 
 		 804 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.07 
 
 		 878 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.17 
 
 		 817 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  35.96 
 
 		 811 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.35 
 
 		 805 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.84 
 
 		 804 aa  308  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.96 
 
 		 879 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.03 
 
 		 913 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  32.1 
 
 		 817 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.48 
 
 		 810 aa  301  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  30.73 
 
 		 798 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 874 aa  297  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.17 
 
 		 806 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  30.52 
 
 		 816 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  33.69 
 
 		 843 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 813 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.57 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.23 
 
 		 887 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  31.34 
 
 		 803 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.92 
 
 		 849 aa  283  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.08 
 
 		 821 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.6 
 
 		 803 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 812 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 844 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  33.25 
 
 		 835 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.27 
 
 		 848 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 855 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.63 
 
 		 810 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  30.43 
 
 		 844 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.42 
 
 		 887 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.78 
 
 		 888 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.52 
 
 		 880 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 810 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  32.2 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.17 
 
 		 919 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.55 
 
 		 846 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  31.53 
 
 		 819 aa  234  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.71 
 
 		 810 aa  225  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.61 
 
 		 820 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.39 
 
 		 807 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.39 
 
 		 884 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.39 
 
 		 931 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.72 
 
 		 828 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 770 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 791 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 794 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 809 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 813 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 798 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 811 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 795 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  22.18 
 
 		 805 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 807 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 804 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 		 793 aa  94  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 		 818 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 802 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 817 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 800 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2598  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 813 aa  90.9  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>