More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2085 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.09 
 
 		 710 aa  789    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  84.34 
 
 		 692 aa  1169    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 699 aa  1394    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  63.44 
 
 		 693 aa  832    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.32 
 
 		 700 aa  874    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  49.03 
 
 		 673 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.81 
 
 		 673 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 670 aa  555  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  44.18 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.71 
 
 		 683 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.87 
 
 		 685 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  43.57 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  43.6 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  43.37 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  45.34 
 
 		 711 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  43.71 
 
 		 711 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.41 
 
 		 675 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  42.98 
 
 		 690 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  43.43 
 
 		 690 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  44.36 
 
 		 681 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.96 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.64 
 
 		 673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 678 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  42.69 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.45 
 
 		 674 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  41.93 
 
 		 677 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.4 
 
 		 670 aa  515  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 669 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.36 
 
 		 671 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 685 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  43.18 
 
 		 685 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 685 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.37 
 
 		 670 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 668 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 670 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 668 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.52 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  43.07 
 
 		 690 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.52 
 
 		 670 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  43.41 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  42.71 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.9 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.45 
 
 		 669 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 672 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  42.26 
 
 		 672 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.56 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 662 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.67 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.35 
 
 		 670 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  43.46 
 
 		 683 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 668 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.86 
 
 		 670 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  42.39 
 
 		 721 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  43.26 
 
 		 694 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  38.65 
 
 		 662 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.15 
 
 		 672 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  42.36 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  43.31 
 
 		 697 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.85 
 
 		 776 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  42.82 
 
 		 671 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.76 
 
 		 776 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 671 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  42.64 
 
 		 670 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.87 
 
 		 784 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.01 
 
 		 776 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 691 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.79 
 
 		 673 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  42.71 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.75 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  42.65 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.99 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  42.2 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  41.03 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  41.32 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  42.51 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  42.29 
 
 		 700 aa  489  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.08 
 
 		 670 aa  489  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  40.78 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  42.2 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  40.35 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  42.75 
 
 		 688 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.21 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 677 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  43.32 
 
 		 683 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.9 
 
 		 682 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 		 693 aa  482  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>