More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0814 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  100 
 
 		 422 aa  876    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  34.77 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  35.84 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  35.99 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  33.92 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  34.44 
 
 		 433 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  36.06 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  35.63 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  35.71 
 
 		 405 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  35.48 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  37.22 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37.99 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.66 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  35.18 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  32.91 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  35.15 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  32.4 
 
 		 438 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  35.86 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  32.09 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.17 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  32.82 
 
 		 409 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  34.12 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  32.11 
 
 		 438 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  34.26 
 
 		 420 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  32.84 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  31.58 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.33 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  33.33 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  31.33 
 
 		 407 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.84 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  31.22 
 
 		 411 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  34.18 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.49 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  34.16 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  34.9 
 
 		 453 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  33.76 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  32.49 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  34.1 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  33.16 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  31.12 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  32.13 
 
 		 370 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  32.26 
 
 		 395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  35.8 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  34.76 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  33.57 
 
 		 426 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  33.74 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  32.35 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  33.25 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  32.67 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  30.35 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  34.2 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  31.38 
 
 		 408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  31.72 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  32.44 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  32.44 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  33.16 
 
 		 613 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.09 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  33.09 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  32.12 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  32.22 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  29.85 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  33.03 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  32.92 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  31.08 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  32.52 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  30.33 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  33.25 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  31.59 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  33.15 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  33.23 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  31.37 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  31.37 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  31.8 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  31.85 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  30.16 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  31.89 
 
 		 394 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  31.87 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  30.32 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  31.38 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  33.08 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  26.45 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  29.67 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.4 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  35.12 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  33.86 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  34.49 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  27.89 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  31.5 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.15 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  28.65 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  30.61 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  27.44 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  30.6 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2956  esterase  27.82 
 
 		 384 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0198492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  27.95 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  34.24 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.97 
 
 		 574 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.05 
 
 		 582 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>