100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0068 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0068  signal transduction ATPase  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.580007  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0822  signal transduction ATPase  39.82 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.552879  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  29.79 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  32.58 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.51 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  26.99 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  26.75 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  25.11 
 
 		 510 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  28.7 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  25.22 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  24.67 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  27.09 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  26.38 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  26.32 
 
 		 509 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  23.21 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  23.89 
 
 		 512 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  23.66 
 
 		 488 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4008  circadian clock protein KaiC  26.52 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  27.27 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  21.17 
 
 		 507 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  21.17 
 
 		 507 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  29.21 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  22.67 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  23.89 
 
 		 509 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  25.74 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  25.89 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  23.21 
 
 		 509 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  24.58 
 
 		 467 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  23.21 
 
 		 509 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  22.77 
 
 		 520 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  22.77 
 
 		 498 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  22.77 
 
 		 521 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  22.32 
 
 		 512 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  22.77 
 
 		 521 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  22.77 
 
 		 528 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  22.22 
 
 		 519 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1328  KaiC  25.88 
 
 		 482 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  22.38 
 
 		 506 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  22.97 
 
 		 362 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.46 
 
 		 482 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  25.98 
 
 		 474 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  22.07 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  22.12 
 
 		 519 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  24.77 
 
 		 505 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  22.03 
 
 		 519 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  23.91 
 
 		 500 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  24.77 
 
 		 562 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 480 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 550 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  26.45 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 498 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  23.7 
 
 		 500 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  26.45 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  24.55 
 
 		 535 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0517  hypothetical protein  27.39 
 
 		 281 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0112529  normal  0.0461896 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  26.87 
 
 		 496 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  24.55 
 
 		 472 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  25.76 
 
 		 573 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 		 504 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  23.15 
 
 		 504 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  24.64 
 
 		 257 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 489 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  24.14 
 
 		 484 aa  48.5  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  23.11 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  25.33 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  26.57 
 
 		 574 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 		 507 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1600  hypothetical protein  26.96 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0751504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  25.11 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  25.11 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  24.55 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  26.87 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  24.29 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  23.58 
 
 		 570 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  25 
 
 		 567 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1678  hypothetical protein  25.54 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  26.2 
 
 		 575 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  23.19 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  23 
 
 		 560 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  24.22 
 
 		 492 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  25.55 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 		 503 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1884  putative circadian clock protein, KaiC  24 
 
 		 569 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.780487  normal  0.628661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0959  flagella-related protein H  26.61 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  27.4 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  23.11 
 
 		 562 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  21.43 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1788  hypothetical protein  25.88 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00651163 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  22.33 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1234  putative circadian clock protein, KaiC  23.33 
 
 		 518 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  25.12 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  24.32 
 
 		 505 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  22.62 
 
 		 489 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  22.03 
 
 		 344 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  22.9 
 
 		 563 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  25.35 
 
 		 301 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  23.56 
 
 		 506 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  23.14 
 
 		 584 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>