More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2626 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 381 aa  780    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  68.21 
 
 		 356 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  51.84 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 333 aa  291  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  43.48 
 
 		 327 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 330 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  38.33 
 
 		 346 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  43.48 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  38.94 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  40.7 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  38.04 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  38.74 
 
 		 561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  39.61 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  37.43 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.17 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  38.72 
 
 		 769 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  36.57 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 414 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 356 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 358 aa  239  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.44 
 
 		 479 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 		 480 aa  212  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 		 496 aa  209  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 501 aa  209  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 389 aa  206  5e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.52 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  31.18 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  31.18 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.91 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.91 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 376 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.17 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 370 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  31.69 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 378 aa  179  8e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.93 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  36.77 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 333 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.97 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.86 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  32.27 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.53 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.55 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.8 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.34 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>