246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4057 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  33.02 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  38.85 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  42 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  47.06 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  37.08 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  38.95 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  46.27 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  43.08 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 317 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  31.82 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 318 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  29.1 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  29.1 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>