121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1732 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  26.57 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  55.32 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  50.94 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  50.94 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  50.94 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  43.28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  43.28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 270 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  34.94 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  35.48 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  38.81 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.29 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 210 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>