176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3897 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  47.41 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  34.02 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  39.02 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  38.61 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  26.92 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  26.92 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  45.21 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  43.06 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  25.57 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  35.65 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  51.92 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  50 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  24.77 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  25.27 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>