230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2891 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  63.51 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  59.05 
 
 		 216 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  57.49 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  57.82 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  53.92 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  54.98 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  53.67 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  37.64 
 
 		 208 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  32.23 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  45.95 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  34.97 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  28.24 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  36.27 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  30.32 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  30.14 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 352 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  30.14 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  41.57 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  55.77 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  45 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  35.11 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 272 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.16 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.16 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>