More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0574 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  27.3 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  35.07 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.16 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  34.75 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  35.29 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 760 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  29.13 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  34.69 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  35.78 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  29.13 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  32.84 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 133 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.67 
 
 		 1355 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 546 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  30.2 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.44 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.74 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  36.89 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  36.89 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  35.35 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 1201 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>