173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0575 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 536 aa  1095    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  36.12 
 
 		 505 aa  246  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  36.16 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  35.74 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  36.1 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  36.1 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  35.46 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  34.24 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  36.4 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  34.41 
 
 		 500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  35.38 
 
 		 647 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  33.88 
 
 		 645 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  32.26 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  34.74 
 
 		 503 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.76 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.85 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  29.76 
 
 		 600 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  28.48 
 
 		 1658 aa  176  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.45 
 
 		 555 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.31 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  30.1 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  30.1 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  30.09 
 
 		 511 aa  157  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  29.92 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  29.92 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  30.64 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.88 
 
 		 513 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  25 
 
 		 684 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  25 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  25 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  25 
 
 		 684 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  25 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  24.42 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  25 
 
 		 684 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  22.16 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  24.81 
 
 		 684 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  30.28 
 
 		 1244 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  25.65 
 
 		 684 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  25.65 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2536  DNA helicase IV  25.21 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000168244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  25.21 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2625  DNA helicase IV  25.21 
 
 		 684 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1074 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4005  hypothetical protein  23.41 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.37 
 
 		 1089 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  30.19 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.68 
 
 		 785 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.07 
 
 		 1051 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 706 aa  53.5  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  26.74 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  29.47 
 
 		 734 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  31.87 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 1127 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  22.64 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  32.94 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 1044 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 676 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  24.6 
 
 		 643 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.09 
 
 		 737 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3746  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 730 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  25.35 
 
 		 685 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 		 783 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  27.5 
 
 		 685 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.52 
 
 		 691 aa  50.8  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.01 
 
 		 722 aa  50.8  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  23.4 
 
 		 684 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  29.08 
 
 		 1033 aa  50.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  30.1 
 
 		 725 aa  50.4  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.27 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.92 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.91 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.56 
 
 		 722 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  32.12 
 
 		 691 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 787 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  26.93 
 
 		 724 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.92 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.85 
 
 		 751 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.85 
 
 		 664 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 774 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  24.03 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.85 
 
 		 664 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 715 aa  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 695 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 917 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.16 
 
 		 739 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 702 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  24.9 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 731 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1544  UvrD/REP helicase  24.43 
 
 		 808 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101134  unclonable  0.000000000582893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 678 aa  47.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 732 aa  47.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 735 aa  47.4  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>