216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0120 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1316    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  44.6 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  36.51 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  36.11 
 
 		 487 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  37.47 
 
 		 481 aa  255  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  36.9 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  36.51 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  36.09 
 
 		 493 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  35.35 
 
 		 493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  35 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.52 
 
 		 555 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  33 
 
 		 1658 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  34.85 
 
 		 536 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.68 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  33.07 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.62 
 
 		 498 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  28.5 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  34.02 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.47 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  32.67 
 
 		 501 aa  180  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.45 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  32.53 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  32.53 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  29.79 
 
 		 499 aa  163  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  29.59 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  29.14 
 
 		 511 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  28.77 
 
 		 500 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  28.62 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0782  ATP-dependent DNA helicase  26.48 
 
 		 675 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0868  putative ATP-dependent DNA helicase  26.26 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1235  putative ATP-dependent DNA helicase  26.26 
 
 		 676 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0798  putative ATP-dependent DNA helicase  26.26 
 
 		 676 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 520 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  26.33 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 783 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 783 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  24.31 
 
 		 602 aa  55.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.1 
 
 		 783 aa  54.3  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0961  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 679 aa  54.3  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0990  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 674 aa  54.3  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 643 aa  53.9  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 676 aa  53.9  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.46 
 
 		 715 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  43 
 
 		 787 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  26.87 
 
 		 728 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  25.72 
 
 		 630 aa  52.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  27.46 
 
 		 729 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  27.55 
 
 		 727 aa  52  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 756 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 720 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  24.45 
 
 		 754 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 759 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.58 
 
 		 849 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  27.21 
 
 		 728 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  27.21 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  25.66 
 
 		 727 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 790 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  26.87 
 
 		 728 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 680 aa  50.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  34.75 
 
 		 689 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  31.78 
 
 		 726 aa  50.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  26.87 
 
 		 728 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.18 
 
 		 739 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 807 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.17 
 
 		 726 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  25.84 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  25.71 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 681 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  27.56 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 768 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 786 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0554  UvrD/REP helicase  34.17 
 
 		 705 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.19 
 
 		 741 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 848 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 721 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 786 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  23.82 
 
 		 814 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 787 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2352  UvrD/REP helicase  34.58 
 
 		 920 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 		 743 aa  48.9  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.12 
 
 		 724 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 735 aa  48.5  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  37.8 
 
 		 715 aa  48.5  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 721 aa  48.5  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 714 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  39.77 
 
 		 714 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 710 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 790 aa  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  32.5 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 729 aa  48.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.08 
 
 		 787 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 728 aa  48.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.08 
 
 		 787 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  24.75 
 
 		 787 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  24.05 
 
 		 786 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  33.04 
 
 		 709 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.08 
 
 		 787 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>