More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2436 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 759 aa  1566    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  31.95 
 
 		 729 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 695 aa  296  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 774 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 678 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.7 
 
 		 662 aa  198  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 809 aa  192  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.48 
 
 		 745 aa  191  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.92 
 
 		 689 aa  191  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 706 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  29.02 
 
 		 666 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4111  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 827 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 797 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 797 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.85 
 
 		 640 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.38 
 
 		 797 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.81 
 
 		 689 aa  180  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  27.58 
 
 		 630 aa  179  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 724 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.21 
 
 		 713 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 		 754 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.31 
 
 		 728 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.67 
 
 		 773 aa  173  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  27.68 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  24.97 
 
 		 722 aa  172  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  27.1 
 
 		 724 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.14 
 
 		 1023 aa  173  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.52 
 
 		 729 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 768 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 		 625 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 757 aa  171  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.56 
 
 		 721 aa  171  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.32 
 
 		 732 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.48 
 
 		 669 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.15 
 
 		 671 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.48 
 
 		 669 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.88 
 
 		 696 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.48 
 
 		 669 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  26.94 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.19 
 
 		 669 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  26.67 
 
 		 726 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.41 
 
 		 669 aa  167  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 		 742 aa  167  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.78 
 
 		 731 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.27 
 
 		 677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  27.39 
 
 		 685 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.48 
 
 		 663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  25.41 
 
 		 669 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 816 aa  165  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  26.92 
 
 		 723 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 757 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 681 aa  164  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.58 
 
 		 718 aa  164  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.94 
 
 		 876 aa  164  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.26 
 
 		 669 aa  164  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  26.86 
 
 		 671 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3990  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.52 
 
 		 670 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  25.06 
 
 		 858 aa  163  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 		 736 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.53 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  24.94 
 
 		 858 aa  163  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3913  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.49 
 
 		 670 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  26.74 
 
 		 657 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 800 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4012  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.49 
 
 		 670 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4106  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.49 
 
 		 685 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.16 
 
 		 763 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 864 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 679 aa  162  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  25.63 
 
 		 724 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.26 
 
 		 671 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.39 
 
 		 685 aa  162  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  25.89 
 
 		 734 aa  161  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.09 
 
 		 671 aa  161  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.39 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  24.96 
 
 		 669 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  27.37 
 
 		 744 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.3 
 
 		 667 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  25.54 
 
 		 724 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 769 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.99 
 
 		 675 aa  160  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.5 
 
 		 671 aa  160  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.24 
 
 		 670 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.89 
 
 		 756 aa  160  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.42 
 
 		 785 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  26.67 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.24 
 
 		 670 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  25.95 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.84 
 
 		 686 aa  159  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 817 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  26.31 
 
 		 668 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.84 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 765 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.36 
 
 		 788 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.35 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  26.54 
 
 		 723 aa  158  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>