79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2003 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  100 
 
 		 499 aa  1040    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  84.74 
 
 		 505 aa  889    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  97.39 
 
 		 499 aa  1022    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  44.42 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  44 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  44 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  40.92 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  36.16 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  33.13 
 
 		 503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.83 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  31.78 
 
 		 481 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  33 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  30.62 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.75 
 
 		 498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  29.79 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  27.57 
 
 		 600 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.68 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  28.74 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.54 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  28.76 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  26.89 
 
 		 487 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  26.55 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  27.51 
 
 		 1658 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  28.82 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.19 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  28.69 
 
 		 493 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  28.28 
 
 		 493 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  22.42 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 774 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 678 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 725 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 520 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 759 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 702 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  32.97 
 
 		 753 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 712 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 564 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 809 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 715 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  46.77 
 
 		 789 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 768 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1518  ATP-dependent helicase PcrA  33.73 
 
 		 766 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.291194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  31.96 
 
 		 779 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  40.91 
 
 		 714 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  33.33 
 
 		 722 aa  45.4  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  46.43 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 720 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  25.97 
 
 		 708 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 736 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  41.54 
 
 		 676 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  43.08 
 
 		 702 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  23.45 
 
 		 723 aa  45.1  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2770  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  35.64 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 700 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 750 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  46.03 
 
 		 745 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.52 
 
 		 730 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  44.64 
 
 		 719 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  40.91 
 
 		 724 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.76 
 
 		 743 aa  44.3  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2514  exodeoxyribonuclease V protein, alpha subunit  34.65 
 
 		 375 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.67 
 
 		 664 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  44.44 
 
 		 685 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  44.44 
 
 		 686 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 685 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0351  hypothetical protein  36.11 
 
 		 388 aa  43.9  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0328547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  30.95 
 
 		 932 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  34.83 
 
 		 372 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 754 aa  43.5  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  35.35 
 
 		 1108 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2796  exodeoxyribonuclease V  36.14 
 
 		 376 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.73 
 
 		 691 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 1074 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>