68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1452 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1011    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  65.77 
 
 		 493 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  97.49 
 
 		 485 aa  972    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  66.19 
 
 		 493 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  49.9 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  44.86 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  45.59 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  35.51 
 
 		 645 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.56 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  36.11 
 
 		 647 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.89 
 
 		 519 aa  223  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.2 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  30.28 
 
 		 1658 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.98 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  29.98 
 
 		 600 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  30.39 
 
 		 501 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  28.25 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  30.1 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  29.26 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.7 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.01 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  27.47 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  29.29 
 
 		 511 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  26.89 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  26.97 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  26.97 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  27.44 
 
 		 500 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 678 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 648 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  35.71 
 
 		 648 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 702 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  34.78 
 
 		 1226 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  38.03 
 
 		 571 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 907 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  22.78 
 
 		 666 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4251  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 715 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 1060 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 741 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 706 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  22.49 
 
 		 759 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1410  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 768 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 744 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  27.62 
 
 		 757 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  36.19 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 716 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  23.91 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 966 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  23.42 
 
 		 725 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  24.5 
 
 		 1174 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  35.23 
 
 		 1349 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 697 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  22.95 
 
 		 666 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4111  UvrD/REP helicase  46.43 
 
 		 827 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 1196 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 697 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  23.08 
 
 		 721 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1579  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 989 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 789 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  39.68 
 
 		 593 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.08 
 
 		 721 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.08 
 
 		 709 aa  43.5  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  43.02 
 
 		 684 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 625 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  32.67 
 
 		 816 aa  43.1  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  37.21 
 
 		 709 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 689 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.93 
 
 		 664 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>