More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3655 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 774 aa  1587    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  34.6 
 
 		 729 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 695 aa  303  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 759 aa  262  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 678 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 682 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  28.55 
 
 		 816 aa  196  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.03 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 825 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 817 aa  190  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 809 aa  188  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.48 
 
 		 729 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  27.1 
 
 		 638 aa  187  8e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.7 
 
 		 669 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 798 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.93 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.1 
 
 		 669 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 671 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 671 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  27.16 
 
 		 720 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.84 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 800 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.26 
 
 		 669 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  27.37 
 
 		 723 aa  181  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  28.55 
 
 		 669 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.26 
 
 		 669 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 625 aa  181  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 795 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 724 aa  180  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 816 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27 
 
 		 785 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.06 
 
 		 669 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.32 
 
 		 739 aa  177  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.4 
 
 		 669 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1369  DNA helicase II  24.53 
 
 		 858 aa  177  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1413  DNA helicase II  24.67 
 
 		 858 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.338777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.59 
 
 		 706 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  26.29 
 
 		 724 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.11 
 
 		 669 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.17 
 
 		 677 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27.4 
 
 		 696 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 726 aa  174  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.5 
 
 		 721 aa  174  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 850 aa  174  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.31 
 
 		 672 aa  174  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  26.18 
 
 		 858 aa  174  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  28.5 
 
 		 721 aa  174  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0008  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 723 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.680024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1764  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 864 aa  174  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 755 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.9 
 
 		 721 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  26.66 
 
 		 797 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.11 
 
 		 673 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.29 
 
 		 725 aa  172  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.76 
 
 		 745 aa  171  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.28 
 
 		 754 aa  171  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.12 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 743 aa  171  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  27.03 
 
 		 634 aa  170  7e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  27.67 
 
 		 724 aa  171  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.57 
 
 		 689 aa  171  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  27.56 
 
 		 723 aa  170  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 669 aa  170  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 707 aa  170  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  28.82 
 
 		 721 aa  170  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.97 
 
 		 713 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.66 
 
 		 787 aa  170  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.68 
 
 		 876 aa  170  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.32 
 
 		 751 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.75 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.2 
 
 		 669 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.22 
 
 		 817 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 807 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0583  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.69 
 
 		 677 aa  168  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.31 
 
 		 705 aa  168  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.85 
 
 		 833 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 751 aa  168  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  27.52 
 
 		 724 aa  167  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.53 
 
 		 1023 aa  167  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 677 aa  167  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  27.17 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.63 
 
 		 729 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.98 
 
 		 663 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.27 
 
 		 690 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  28.31 
 
 		 669 aa  167  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.91 
 
 		 786 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  26.37 
 
 		 726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 804 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 778 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.29 
 
 		 768 aa  165  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.47 
 
 		 672 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  28.01 
 
 		 807 aa  165  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.08 
 
 		 739 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>