21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0793 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1335    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2564  hypothetical protein  32.26 
 
 		 636 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3150  hypothetical protein  32.26 
 
 		 665 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2895  hypothetical protein  31.34 
 
 		 637 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2705  hypothetical protein  31.31 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309228  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4005  hypothetical protein  27.72 
 
 		 626 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1803  hypothetical protein  24.08 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  21.98 
 
 		 505 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  22.44 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  22.42 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  22.16 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  22.16 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  22.82 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  22.16 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  24.51 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  22.01 
 
 		 481 aa  54.7  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  21.14 
 
 		 486 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  22.24 
 
 		 498 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  21.72 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  21.11 
 
 		 647 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  23.7 
 
 		 519 aa  43.9  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>