14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2705 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3150  hypothetical protein  94.65 
 
 		 665 aa  1243    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2564  hypothetical protein  94.65 
 
 		 636 aa  1240    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2705  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1304    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309228  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2895  hypothetical protein  90.58 
 
 		 637 aa  1194    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  31.31 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4005  hypothetical protein  29.17 
 
 		 626 aa  223  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1803  hypothetical protein  25.94 
 
 		 671 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  27.04 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  23.13 
 
 		 645 aa  54.3  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  25.77 
 
 		 509 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  24.55 
 
 		 503 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.18 
 
 		 519 aa  47.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  25.71 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  22.46 
 
 		 1658 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>