62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_14422 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  100 
 
 
1658 aa  3420    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  31.02 
 
 
645 aa  229  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  32.95 
 
 
647 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  32.56 
 
 
481 aa  216  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  31.99 
 
 
503 aa  216  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  32.4 
 
 
509 aa  211  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  31.73 
 
 
493 aa  208  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  31.55 
 
 
493 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.23 
 
 
519 aa  201  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  30.28 
 
 
487 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  30.29 
 
 
485 aa  194  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  28.42 
 
 
498 aa  181  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  28.48 
 
 
536 aa  177  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.6 
 
 
555 aa  167  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  26.67 
 
 
500 aa  166  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  27.29 
 
 
518 aa  165  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  29.58 
 
 
501 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.01 
 
 
513 aa  149  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  28.8 
 
 
486 aa  139  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  26.28 
 
 
600 aa  137  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.71 
 
 
505 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  27.16 
 
 
499 aa  135  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  26.74 
 
 
499 aa  131  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  28.02 
 
 
486 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  28.02 
 
 
486 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  30.23 
 
 
500 aa  99  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  25.87 
 
 
511 aa  93.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 
564 aa  56.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  24.23 
 
 
701 aa  55.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 
774 aa  53.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  28.38 
 
 
587 aa  53.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 
520 aa  53.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.24 
 
 
719 aa  52.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0786  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 
685 aa  51.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.91065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 
729 aa  51.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 
678 aa  50.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 
1074 aa  49.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  32.65 
 
 
759 aa  49.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 
695 aa  48.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  21.62 
 
 
697 aa  48.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  23.13 
 
 
787 aa  48.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  21.22 
 
 
557 aa  48.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3150  hypothetical protein  22.81 
 
 
665 aa  47.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  32.69 
 
 
915 aa  47.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 
1027 aa  47.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  26.52 
 
 
677 aa  48.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 
655 aa  47.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2564  hypothetical protein  22.81 
 
 
636 aa  47.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1138  DNA helicase IV  24.77 
 
 
684 aa  46.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 
720 aa  46.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  23.22 
 
 
712 aa  46.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  25.2 
 
 
921 aa  46.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 
648 aa  46.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  32.11 
 
 
1047 aa  46.2  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  25.6 
 
 
921 aa  46.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 
648 aa  46.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1184  DNA helicase IV  24.77 
 
 
684 aa  46.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1033  DNA helicase IV  24.77 
 
 
684 aa  45.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0811314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1116  DNA helicase IV  25 
 
 
684 aa  45.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516888 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  27.11 
 
 
921 aa  45.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  23.58 
 
 
719 aa  45.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1150  DNA helicase IV  24.77 
 
 
684 aa  45.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>