243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3358 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1052    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  67.43 
 
 		 481 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  49.6 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  45.59 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  45.17 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  44.49 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  44.1 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  38.08 
 
 		 645 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.84 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  36.9 
 
 		 647 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.27 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  35.27 
 
 		 498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  34.24 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  32.4 
 
 		 1658 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  33.79 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.49 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  29.67 
 
 		 600 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  32.42 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  32.42 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  30.91 
 
 		 501 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  30.22 
 
 		 500 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.17 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  30.83 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  30.62 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  30.69 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.89 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  29.42 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 774 aa  70.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  26.72 
 
 		 520 aa  67.8  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3778  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 695 aa  60.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 759 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 1074 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  33.87 
 
 		 1226 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2895  hypothetical protein  25.51 
 
 		 637 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 681 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 687 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2564  hypothetical protein  25.17 
 
 		 636 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2705  hypothetical protein  25.77 
 
 		 636 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309228  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3150  hypothetical protein  25.17 
 
 		 665 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03797  DNA helicase and DNA-dependent ATPase (Eurofung)  44 
 
 		 997 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2454  helicase IV  33.65 
 
 		 1042 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  37.37 
 
 		 1123 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  23.86 
 
 		 907 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 		 616 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1027 aa  50.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0599  UvrD/REP helicase  39.8 
 
 		 697 aa  50.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 753 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  31.03 
 
 		 751 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 768 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.43 
 
 		 710 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 753 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 747 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 747 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 751 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  31.03 
 
 		 753 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 747 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 751 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 751 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.59 
 
 		 766 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  27.21 
 
 		 728 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.95 
 
 		 741 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.58 
 
 		 719 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4281  UvrD/REP helicase  38.64 
 
 		 716 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344477  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 729 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  26.27 
 
 		 721 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.67 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1057 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 678 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  27.21 
 
 		 728 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2292  UvrD/REP helicase  33.02 
 
 		 996 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.359133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  27.21 
 
 		 728 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3889  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 996 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126347  hitchhiker  0.000335054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 		 754 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  30.24 
 
 		 1196 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 783 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 591 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.07 
 
 		 694 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  32.95 
 
 		 684 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0128  putative ATP-dependent DNA helicase rep protein  38.67 
 
 		 693 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570689  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3941  UvrD/REP helicase  23.47 
 
 		 1004 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1099 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  33.05 
 
 		 725 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.74 
 
 		 1236 aa  47.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0352  UvrD/REP helicase  36.46 
 
 		 709 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.877458  normal  0.0118212 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5440  UvrD/REP helicase  36.47 
 
 		 1051 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 848 aa  47.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6795  UvrD/REP helicase  23.48 
 
 		 571 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692778  normal  0.357242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  40.74 
 
 		 1054 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>