More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4050 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  67.43 
 
 		 509 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  1000    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  51.17 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  44.86 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  44.79 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  44.12 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  43.91 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  39.79 
 
 		 645 aa  306  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  37.47 
 
 		 647 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  34.62 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.53 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  36.4 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  32.56 
 
 		 1658 aa  216  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  32.71 
 
 		 498 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.76 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 600 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.61 
 
 		 505 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  31.43 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  31.78 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  31.16 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  31.45 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  31.69 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  31.69 
 
 		 486 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  29.76 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  29.9 
 
 		 500 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.55 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  27.07 
 
 		 511 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.17 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 774 aa  63.9  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.06 
 
 		 685 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3150  hypothetical protein  26.57 
 
 		 665 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2564  hypothetical protein  26.57 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  28.78 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  28.78 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.34 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2705  hypothetical protein  27.04 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309228  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  36.8 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  29.64 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 731 aa  56.6  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 729 aa  56.6  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.13 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03797  DNA helicase and DNA-dependent ATPase (Eurofung)  41.56 
 
 		 997 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  27.63 
 
 		 736 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2854  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 643 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00578571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  28.86 
 
 		 728 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  28.86 
 
 		 728 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0793  hypothetical protein  22.01 
 
 		 646 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 681 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  29.27 
 
 		 684 aa  53.9  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  27.27 
 
 		 687 aa  53.9  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 1027 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1214  DNA helicase IV  24.73 
 
 		 685 aa  53.9  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1045  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 587 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52657  normal  0.201232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1074 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 1001 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  28.79 
 
 		 727 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.98 
 
 		 699 aa  53.5  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 907 aa  53.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  27.87 
 
 		 773 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 1060 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 682 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  28.36 
 
 		 729 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 1135 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  28.87 
 
 		 715 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2853  DNA helicase IV  25.81 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0621  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.28 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  24.59 
 
 		 685 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  28.67 
 
 		 920 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3046  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 697 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.672611  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1119  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.28 
 
 		 691 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  31.58 
 
 		 1392 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  34.41 
 
 		 1226 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 764 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 681 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 736 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27.14 
 
 		 726 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  22.92 
 
 		 1050 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2895  hypothetical protein  27.74 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 735 aa  51.2  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1244  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.28 
 
 		 691 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 951 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0339  UvrD/REP helicase  37.93 
 
 		 687 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 714 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3778  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 		 689 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  34.17 
 
 		 674 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.27 
 
 		 655 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1179  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 701 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0987227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  28.35 
 
 		 727 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.67 
 
 		 745 aa  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.3 
 
 		 727 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2544  DNA helicase IV  25.16 
 
 		 685 aa  50.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.057684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.63 
 
 		 729 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3204  DNA helicase IV  27.61 
 
 		 684 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.0880304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  32.31 
 
 		 1282 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>