More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0926 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  100 
 
 		 498 aa  1004    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  35.48 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  34.74 
 
 		 645 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.48 
 
 		 500 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.99 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  34.84 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  35.27 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  35.13 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  32.71 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  30.57 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  30.49 
 
 		 647 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.17 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  31.6 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  28.66 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  30.98 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  30.91 
 
 		 493 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  28.42 
 
 		 1658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  30.51 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  29.41 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  29.41 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  31.43 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.07 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.12 
 
 		 513 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  30.75 
 
 		 499 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  28.6 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  27.45 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3792  UvrD/REP helicase  22.59 
 
 		 736 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.976756  normal  0.84533 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 768 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 1177 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.18 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.62 
 
 		 719 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  22.16 
 
 		 1032 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.89 
 
 		 706 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 729 aa  62  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  22.8 
 
 		 714 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  23.43 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.44 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 783 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 807 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.76 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  25.79 
 
 		 702 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  25.25 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.3 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  40.23 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.96 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  20.28 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0149  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 695 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 717 aa  57  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 564 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.15 
 
 		 669 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 731 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  20.73 
 
 		 1141 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.89 
 
 		 672 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0163  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2905  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0137  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0150  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3919  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 695 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0828794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.93 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3991  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 695 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282307  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2967  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4386  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 697 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 		 789 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3002  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  25.21 
 
 		 669 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3067  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0122  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 678 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3260  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 848 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1535  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.96 
 
 		 768 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3303  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.51 
 
 		 700 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1807  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 710 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388525  normal  0.14229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.68 
 
 		 756 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.75 
 
 		 772 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3329  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 695 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544954  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0060  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.11 
 
 		 696 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.25 
 
 		 758 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 676 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3877  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 696 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  39.24 
 
 		 1180 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5264  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.57 
 
 		 669 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5174  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.57 
 
 		 669 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 		 721 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  22.04 
 
 		 700 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 932 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 755 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  23.1 
 
 		 659 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5316  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.57 
 
 		 669 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640166  normal  0.0761543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1033 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  23.45 
 
 		 809 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0206  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.96 
 
 		 669 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0188843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>